八十年以前，有五个对于菲律宾年轻人充满理想的教育家，他们共同的目标在建立一个能够成功地塑造年轻人智力及品行的学习机构，于是本着不屈不挠的精神，他们在公元1913年建立了第一个教育机构INSTITUTO DE MANILA，为当地之民众提供了更好的小学及中学教育设备。而为了因应国家发展及人民教育的提升，这些教育家更一致的希望能将教育工作扩大，于是他们在公元1921年将 INSTITUTO DE MANILA提升为马尼拉大学。
马尼拉大学最初由法律学院、文学院、哲学及语文学院、教育学院及企业管理学院所构成，并于几年内增加了研究所部门、工学院、音乐学会及国际事务学院，使其早期即成为一所具备各种课程提供的综合大学，而本着教育理应是顺应潮流及不断求新进步的理念，其更于80年代加入了观光事业、饭店及餐饮管理、计算器科技等课程;在90年代，马尼拉大学更规划了教育博士、公共行政管理博士及企管硕士等课程，为企业及政府部门之高阶主管提供了进一步学习之管道。
八十年来，马尼拉大学提供了菲律宾及亚洲的年轻人第二个家，这个家透过品性教育给予他们更好的环境去学习未来工作的技能，正如马尼拉大学的****一样「对优秀的学术完全的投入」，是对教育事业希望的重申及信念的再造。
马尼拉大学企业管理学院于公元1992年建立，它的主要目标有四点：
·训练培养未来的企业领导者及行政人员，使其作好准备并具有处理商业及工业等各种有关于经济事务的能力。
·帮助稳定国家经济。
·使学生具备必要的知识并熟练精通于总体经济学，练习如何成为一个有效率的企业管理领导者。
·开发学生对面临企业问题时所需的分析组织及判断能力。
因为意识到国家的发展取决于经济，而在国家发展初期又常会欠缺企业及经济人才，所以马尼拉大学企业管理学院长久来一直极力于培养对经济发展有贡献的企业管理人才，其主要的课程领域如下：会计学、银行及金融、管理、销售及经济学，期能透过如此的教育来帮助国家的经济发展。
在工业和商业快速成长的国家，企业内部每日面临许多杂务工作等待秘书处理，有鉴于此，马尼拉大学在公元1962年开办了秘书教育课程，并于日后纳入企业管理学院。用现代商业机器设备，提供了未来办公室秘书人员所需的完整训练。在时代潮流驱使之下，这所学院更进而提供计算器教学课程来充实秘书的本质学能。