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地衣类中药
药用部位为地衣类植物体的地衣体，这类中药称为地衣类中药。
地衣是藻类和真菌共生的复合体。具有独特的形态、结构、生理和遗传等生物学特性。地衣中共生的真菌绝大多数为子囊菌，少数为担子菌;藻类是蓝藻及绿藻。它们的形态分为壳状、叶状或枝状。
构造也不相同。枝状地衣内部构造呈辐射状，具有致密的外皮层、薄的藻孢层以及中轴型的髓，如松萝科的地衣。
地衣含特有的地衣酸、地衣色素、地衣多糖、蒽醌类、地衣淀粉等成分。最特殊的是地衣酸类，有的只存在于地衣体中。大约有50%的地衣类含有抗菌活性物质，如抗菌消炎的松萝酸。常用的地衣类中药如松萝。
菌类中药
药用部位主要为菌类的菌核、子实体或子座与幼虫尸体的复合体，这类中药称为菌类中药。
菌类一般不含有光合作用的色素，不能进行光合作用，营养方式为异养。与药用关系密切的是细菌门和真菌门。
细菌是单细胞植物，无真正的核，细胞壁主要由蛋白质、类脂质和多糖复合物组成，一般不具纤维素壁。其中放线菌是抗生素的主要产生菌，迄今已知的抗生素中，有2/3是由放线菌产生的，如氯霉素、链霉素、金霉素、土霉素、四环素等。
真菌是有细胞核的植物，细胞壁大多具有几丁质成分，少数含有纤维素。真菌的营养体除少数原始种类是单细胞外，一般都是由多数分枝或不分枝，分隔或不分隔的菌丝交织在一起，组成菌丝体。
储藏的营养物质是肝糖、油脂和菌蛋白，不含淀粉。
中药药用以真菌门为主，真菌类中药以子囊菌纲和担子菌纲植物为最多。
子囊菌的主要特征是在特殊的子囊中形成子囊孢子来繁殖，如冬虫夏草、蝉花、竹黄等药用菌。
担子菌的主要特征是在特殊的担子上形成担孢子来繁殖。药用部分主要是子实体，如马勃、灵芝等;菌核，如猪苓、茯苓、雷丸等。
菌类常含多糖、氨基酸、生物碱、蛋白质、蛋白酶、甾醇和抗菌素等成分。其中多糖类如灵芝多糖、茯苓多糖、猪苓多糖、银耳多糖、云芝多糖等有增强免疫及抗肿瘤作用。
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