国立、公立大学间差距较小
与众多私立大学相比较，日本国立、公立大学相对质量比较均一，不存在超一流私立大学与危险大学之间的“天壤之别”。这是因为，“公立大学”目前还不存在质量低劣的大学。即便个别某所地方国、公立大学因生源不足发生运营困难，其解决的方式通常是与就近的国、公立大学合并，受损害的最多的是学校的教师(教授)，而学生一方不会有什么损害。但国立大学相对自由度较小，政策转变较慢，通常设置新型学科不是件容易事。另外一点就是招生体制保守，目前日本国、公立大学招生基本局限于日本国内招生，留学生想要报考日本国、公立大学通常需要经过半年到1年语言学校预备教育过渡，在日本完成升学。
日本私立大学差距巨大
众所周知，日本大学分为三大类：国立、公立和私立。其中私立大学有500所左右，占到日本大学总数的三分之二，为日本培养了众多人才，更成为日本经济发展的中坚力量。私立大学由于具备政策转换灵活、与市场结合紧密等特点，受到学生和家长的欢迎。但伴随着日本“少子化”的加剧，私立大学的生存面临巨大挑战。一些私立大学开始积极开拓海外市场，以抢占生源。但500多所私立大学的质量差距较大。从超一流大学到危险大学可谓全部囊括。“危险大学”，时刻存在着倒闭的危险，特别应该引起中国留学生的注意。尽管日本已跨入大学“全入时代”(即大学计划招生人数与实际录取人数持平时代)，但考取日本名校的难度丝毫未降低。根据日本相关法规定，留学生日语具备2级(中级日语水平)，可直接申请日本大学。但一些名牌大学对外国申请者除了语言方面的高要求外，对基础学历也有严格的考察。